RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 AP2B1P63010 937 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 OGDHQ02218 1023 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ACTL9Q8TC94 416 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.59■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 E5RJQ4 531 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM63AO94886 807 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZCCHC18P0CG32 403 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ACTR3P61158 418 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TREML1Q86YW5 311 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC44A1Q8WWI5 657 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NCSTNQ92542 709 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PANX3Q96QZ0 392 aa15.58■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RGS20O76081 388 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PYGBP11216 843 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 BAG6P46379 1132 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PRKCEQ02156 737 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FAAP100Q0VG06 881 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TTC13Q8NBP0 860 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO27Q8NI29 283 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 EPAS1Q99814 870 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 GPAMQ9HCL2 828 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CHMP2BQ9UQN3 213 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 INHBAP08476 426 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KCNA2P16389 499 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRAP18433 802 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 WNT7BP56706 349 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DCAF15Q66K64 600 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 GPRASP2Q96D09 838 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 C7orf26Q96N11 449 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.58■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 I3L4J1 428 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PEX10O60683 326 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PSAPP07602 524 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PSMC4P43686 418 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DYNLT1P63172 113 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MTM1Q13496 603 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RASIP1Q5U651 963 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF606Q8WXB4 792 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 VCX3BQ9H321 246 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRJQ12913 1337 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GVG6 124 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CDK7P50613 346 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ACTR2P61160 394 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TAP1Q03518 808 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CDC16Q13042 620 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM143Q96AN5 459 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CENPKQ9BS16 269 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 WWP1Q9H0M0 922 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SLC7A8Q9UHI5 535 aa15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PPME1Q9Y570 386 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms