RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5C2P49902 561 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK7P50613 346 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEK2P51955 445 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAPAP54920 295 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL13RA1P78552 427 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ROM1Q03395 351 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSPNQ14714 243 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGISQ16647 500 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CT83Q5H943 113 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM240Q5SV17 173 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC62Q6P9F0 684 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMTC3Q6ZXV5 915 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM129CQ86XR2 697 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 STPG3Q8N7X2 389 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 KYQ8NBH2 561 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPM1EQ8WY54 764 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 CUL5Q93034 780 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIFAQ96CG3 184 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM84AQ96KN4 292 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA33Q96N06 139 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOX2Q96NM4 488 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTBD2Q9BX70 525 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIOX1Q9H6W3 641 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL23AQ9NPF7 189 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCND1Q9NSA2 647 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCOR1O75376 2440 aa5.03□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC3P53804 2025 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC28Q96AY4 2481 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS38A1L453 326 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB43O43298 467 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSPG5O95196 566 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 LGALS2P05162 132 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYBL2P10244 700 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYOGP15173 224 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SP2Q02086 613 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCL1Q07820 350 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADCY2Q08462 1091 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NECTIN1Q15223 517 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 STILQ15468 1287 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGKDQ16760 1214 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZUG5 572 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC8DQ7L1W4 858 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP38Q8NB14 1042 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPTC7Q8NI37 304 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALML6Q8TD86 181 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KAT2BQ92831 832 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLIC6Q96NY7 704 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACAP3Q96P50 834 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEK1Q96PY6 1258 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 IWS1Q96ST2 819 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10A5Q9H207 317 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CERS4Q9HA82 394 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CROTQ9UKG9 612 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q9Y3F1 56 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRAK3Q9Y616 596 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIP11Q15643 1979 aa5.02□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEIS2O14770 477 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAX4O43316 350 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FIBPO43427 364 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPLP06858 475 aa5.01□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CA3P07451 260 aa5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms