RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.9□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PPP1R3BQ86XI6 285 aa4.9□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 CNTD1Q8N815 330 aa4.9□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.9□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PHLDB1Q86UU1 1377 aa4.9□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 VNN1O95497 513 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ADORA2AP29274 412 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 NOGQ13253 232 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SEC23BQ15437 767 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ASIC2Q16515 512 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ATL2Q8NHH9 583 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 WBP1Q96G27 269 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TEKT5Q96M29 485 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 CES2O00748 559 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MT-CO1P00395 513 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 LRPAP1P30533 357 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 HK3P52790 923 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SATB1Q01826 763 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MYO1EQ12965 1108 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM65Q6PI78 240 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 RANBP10Q6VN20 620 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF479Q96JC4 524 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.88□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PRSS47A8MTI9 375 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC16A6O15403 523 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 NGFRP08138 427 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TNFRSF1BP20333 461 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 CNGA1P29973 690 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 VIPR2P41587 438 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 RSPRY1Q96DX4 576 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 LMLNQ96KR4 655 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MEIS3Q99687 375 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MCM8Q9UJA3 840 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 UNC5CO95185 931 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PLA2G2AP14555 144 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 HDCP19113 662 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 CDC25AP30304 524 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 GKP32189 559 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MANEAQ5SRI9 462 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 NLRP4Q96MN2 994 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PSMD9O00233 223 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 IGKV3-20P01619 116 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 GRPP07492 148 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 FGF2P09038 288 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TYRP14679 529 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TNFRSF8P28908 595 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 LMAN2Q12907 356 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 STIM1Q13586 685 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 KRT26Q7Z3Y9 468 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC25A28Q96A46 364 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SELENONQ9NZV5 590 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 XPR1Q9UBH6 696 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MAFFQ9ULX9 164 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 PMPCBO75439 489 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 MYBL2P10244 700 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 EMC10Q5UCC4 262 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms