RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PRKAR1B	P31321	381 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	DGKE	P52429	567 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ANAPC15	P60006	121 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	E2F1	Q01094	437 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	MLC1	Q15049	377 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PLA1A	Q53H76	456 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CUL5	Q93034	780 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	AMFR	Q9UKV5	643 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	KAT6A	Q92794	2004 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PBRM1	Q86U86	1689 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	E2F8	A0AVK6	867 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	BTN3A1	O00481	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	DSCR3	O14972	297 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PHKG2	P15735	406 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	IL1R2	P27930	398 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	MTHFS	P49914	203 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	RENBP	P51606	427 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB32	Q13637	225 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	RABEP1	Q15276	862 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	DENND2C	Q68D51	928 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	LRGUK	Q96M69	825 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A087WWL8	130 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283		H3BML4	177 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CES2	O00748	559 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	KCNA3	P22001	575 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC13A2	Q13183	592 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	LAMB3	Q13751	1172 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	LY6K	Q17RY6	165 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	C4orf46	Q504U0	113 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC17	Q96LX7	622 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAMTS12	P58397	1594 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	BTBD19	C9JJ37	291 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ALDH1L1	O75891	902 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	UBXN7	O94888	489 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ABLIM3	O94929	683 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	VNN1	O95497	513 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	FPR3	P25089	353 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CCNI	Q14094	377 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	AIFM3	Q96NN9	605 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	MMS19	Q96T76	1030 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	USP22	Q9UPT9	525 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	TOP2B	Q02880	1626 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	MYMK	A6NI61	221 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	KIT	P10721	976 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	NPR1	P16066	1061 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	CTBP1	Q13363	440 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTPN4-204	ENST00000431283	FHL1	Q13642	323 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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