RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 MGEA5O60502 916 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TRPA1O75762 1119 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 KLRC2P26717 231 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CLCNKBP51801 687 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 BCAT1P54687 386 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 KRT71Q3SY84 523 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM121Q9BTD3 319 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CHST12Q9NRB3 414 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 GPR182O15218 404 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 PCK1P35558 622 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 MMRN1Q13201 1228 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ACAP1Q15027 740 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC89Q8N998 374 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 NOD1Q9Y239 953 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CLDN5O00501 218 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 THP07101 528 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 VCPP55072 806 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 P3H1Q32P28 736 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 RFX6Q8HWS3 928 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ACTL9Q8TC94 416 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SDC4P31431 198 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 OASLQ15646 514 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 IZUMO3Q5VZ72 239 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 HACE1Q8IYU2 909 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TNIP3Q96KP6 325 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 PRPSAP2O60256 369 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 IFNB1P01574 187 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 RARGP13631 454 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 HPDP32754 393 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CDH6P55285 790 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SLMAPQ14BN4 828 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ALLCQ8N6M5 410 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 STK32AQ8WU08 396 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SENP8Q96LD8 212 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SRRDQ9UH36 339 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM23A6NLE4 172 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ARSEP51690 589 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ITGA7Q13683 1181 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TAZQ16635 292 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 RPAINQ86UA6 219 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SGK1O00141 431 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 RIPK2O43353 540 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 LMNB2Q03252 620 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 LPIN1Q14693 890 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 BBS12Q6ZW61 710 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 FUKQ8N0W3 1084 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 POMCP01189 267 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT17P0C025 328 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 NR1D1P20393 614 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 BEST1O76090 585 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ACSL3O95573 720 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35B2Q8TB61 432 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ACLYP53396 1101 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SNX16P57768 344 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 GPS1Q13098 491 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms