RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
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ANKRD54-203ENST00000407117 GPR179Q6PRD1 2367 aa29.48■■■□□ 2.31
ANKRD54-203ENST00000407117 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ANKRD54-203ENST00000407117 YWHAQP27348 245 aa29.48■■■□□ 2.31
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ANKRD54-203ENST00000407117 TIGD1Q96MW7 591 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKRD54-203ENST00000407117 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
ANKRD54-203ENST00000407117 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
ANKRD54-203ENST00000407117 C2orf42Q9NWW7 574 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKRD54-203ENST00000407117 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
ANKRD54-203ENST00000407117 STX10O60499 249 aa29.41■■■□□ 2.3
ANKRD54-203ENST00000407117 EPB41P11171 864 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
ANKRD54-203ENST00000407117 ID4P47928 161 aa29.41■■■□□ 2.3
ANKRD54-203ENST00000407117 FNTBP49356 437 aa29.41■■■□□ 2.3
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