RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 FAM84AQ96KN4 292 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 RAXQ9Y2V3 346 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 GABRDO14764 452 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 IL18RAPO95256 599 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PFKLP17858 780 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PLCG1P19174 1290 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEA11P43364 429 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 FAM171BQ6P995 826 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA17Q96L03 361 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SYPP08247 313 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ADH5P11766 374 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ADSSP30520 456 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SLC14A1Q13336 389 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 NAXDQ8IW45 347 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf38Q8TB03 319 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 HCN2Q9UL51 889 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PQD8 194 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 OLFM2O95897 454 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 BDNFP23560 247 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 WASP42768 502 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 LHX1P48742 406 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 MCM6Q14566 821 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 NAT16Q8N8M0 369 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 MYLPFQ96A32 169 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRBP23467 1997 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ADH1CP00326 375 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ABL1P00519 1130 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 LMO2P25791 158 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PCSK1P29120 753 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 GRIK1P39086 918 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 VSTM1Q6UX27 236 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SYT15Q9BQS2 421 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 KRT19P08727 400 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 HOXB2P14652 356 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ABCD1P33897 745 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 MIB1Q86YT6 1006 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CD93Q9NPY3 652 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 BPTFQ12830 3046 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PQF6 199 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM24O15164 1050 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms