RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ADRA1DP25100 572 aa16.99■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SOX10P56693 466 aa16.99■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 NPY5RQ15761 445 aa16.99■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ARSHQ5FYA8 562 aa16.99■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.99■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.99■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.99■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ULK4Q96C45 1275 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 HSD17B14Q9BPX1 270 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 FSCN2O14926 492 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMM44O43615 452 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 DGKIO75912 1065 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 RALBP11234 206 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 TGM2P21980 687 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 GTF2BQ00403 316 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 STX5Q13190 355 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ORC1Q13415 861 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 USP33Q8TEY7 942 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 CCT7Q99832 543 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 AKAP12Q02952 1782 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 F8W8V4 182 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINB8P50452 374 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 HDAC4P56524 1084 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 BMPR2Q13873 1038 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.312e-7■□□□□ 10.2
CTDSP2-201ENST00000398073 E5RI56 91 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 GH1P01241 217 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNJ2P63252 427 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ANO4Q32M45 955 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ACP6Q9NPH0 428 aa16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A27O95847 323 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 FLT3P36888 993 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 FMO1Q01740 532 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 PPATQ06203 517 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 IMPG1Q17R60 797 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 DPP3Q9NY33 737 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 KBTBD13C9JR72 458 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK16Q00536 496 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00523Q86TU6 105 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SOX13Q9UN79 622 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM150BA6NC51 233 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 CACNA2D1P54289 1103 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF235Q14590 738 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SV2CQ496J9 727 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF1AQ12756 1690 aa16.97■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6V1B1P15313 513 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 QPCTQ16769 361 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC38Q5VT99 294 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 VCAM1P19320 739 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA1841Q6NSI8 718 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 IRGCQ6NXR0 463 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 TBCBQ99426 244 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 OPLAHO14841 1288 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF398Q8TD17 642 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 DDI1Q8WTU0 396 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms