RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE6CP51160 858 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 MTF1Q14872 753 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR44Q5JSH3 913 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TTI2Q6NXR4 508 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 WHAMMQ8TF30 809 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP63Q96MT8 703 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SMOQ99835 787 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 EBF3Q9H4W6 596 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 HPS4Q9NQG7 708 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 PFKLP17858 780 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC5A3P53794 718 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 USP4Q13107 963 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF77Q15935 545 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO32Q969P5 355 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC35C1Q96A29 364 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 BICDL2A1A5D9 508 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFRSF10BO14763 440 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 LAMTOR5O43504 91 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 BEST1O76090 585 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM200BP0CF97 657 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 ARSAP15289 507 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K7CLP57077 242 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 RUNX3Q13761 415 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CAMK4Q16566 473 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TATDN2Q93075 761 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 ARID3AQ99856 593 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PROB1E7EW31 1015 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 SP9P0CG40 484 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CHRNB1P11230 501 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 STX17P56962 302 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PDGFRLQ15198 375 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF394Q53GI3 561 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF38Q9H0F5 515 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CHRDQ9H2X0 955 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CISHQ9NSE2 258 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 IL37Q9NZH6 218 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 OLFM2O95897 454 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TCF3P15923 654 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 IFNAR2P48551 515 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC7A9P82251 487 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 MTAPQ13126 283 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PAK1Q13153 545 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PON2Q15165 354 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC39CQ8N584 583 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 JAKMIP2Q96AA8 810 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 COMMD8Q9NX08 183 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 LEFTY2O00292 366 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 GFRA3O60609 400 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FMO5P49326 533 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 ZXDBP98169 803 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC32Q14392 662 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 GMIPQ9P107 970 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CPQQ9Y646 472 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 R4GN57 208 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PIEZO1Q92508 2521 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD23BP54727 409 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CUL2Q13617 745 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms