RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa31.19■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 PPM1LQ5SGD2 360 aa31.19■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 NAA35Q5VZE5 725 aa31.19■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa31.19■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 SLC30A5Q8TAD4 765 aa31.19■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 GIPC2Q8TF65 315 aa31.19■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 CPA5Q8WXQ8 436 aa31.19■■■□□ 2.58
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ECHS1-201ENST00000368547 GREB1Q4ZG55 1949 aa31.19■■■□□ 2.58
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ECHS1-201ENST00000368547 UNGP13051 313 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
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ECHS1-201ENST00000368547 PLD1Q13393 1074 aa31.17■■■□□ 2.58
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ECHS1-201ENST00000368547 KCTD13Q8WZ19 329 aa31.16■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
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ECHS1-201ENST00000368547 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
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ECHS1-201ENST00000368547 CEP295NLQ96MC4 621 aa31.15■■■□□ 2.58
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC4A5Q9BY07 1137 aa31.14■■■□□ 2.58
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.57
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ECHS1-201ENST00000368547 RAB41Q5JT25 222 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ACAD10Q6JQN1 1059 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 TSGA10Q9BZW7 698 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CLDND1Q9NY35 253 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 TJP2Q9UDY2 1190 aa31.13■■■□□ 2.57
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ECHS1-201ENST00000368547 GZMAP12544 262 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 LCP1P13796 627 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 RPL34P49207 117 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
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ECHS1-201ENST00000368547 ADIGQ0VDE8 80 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CTC1Q2NKJ3 1217 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa31.13■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1328Q86T90 577 aa31.13■■■□□ 2.57
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ECHS1-201ENST00000368547 SFXN1Q9H9B4 322 aa31.13■■■□□ 2.57
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ECHS1-201ENST00000368547 E5RJQ4 531 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CSH1P0DML2 217 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CSH2P0DML3 217 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 TNNT1P13805 278 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP25P42331 645 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 TKTL1P51854 596 aa31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
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ECHS1-201ENST00000368547 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
ECHS1-201ENST00000368547 EP400NLQ6ZTU2 488 aa31.12■■■□□ 2.57
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