RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349062.6

TRIM4-201, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 3,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-201ENST00000349062 GPD2P43304 727 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 NME3Q13232 169 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CYP1B1Q16678 543 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 NOTUMQ6P988 496 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CD302Q8IX05 232 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 DONSONQ9NYP3 566 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 GJD2Q9UKL4 321 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 ATP8B3O60423 1300 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CDKN2BP42772 138 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SCTRP47872 440 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 GRB14Q14449 540 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.081e-5■■■□□ 16.7
TRIM4-201ENST00000349062 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TTC30AQ86WT1 665 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 FAM131BQ86XD5 332 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 BEST2Q8NFU1 509 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 PEBP4Q96S96 227 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 ASB7Q9H672 318 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 BRAFP15056 766 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 KDELR1P24390 212 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CA9Q16790 459 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TMEM120BA0PK00 339 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 VDRP11473 427 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 GPD1P21695 349 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 IVDP26440 423 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 PSEN2P49810 448 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 PTK6Q13882 451 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TRNP1Q6NT89 227 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 UBR7Q8N806 425 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 48.7
TRIM4-201ENST00000349062 KATNBL1Q9H079 304 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SPTLC1O15269 473 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TTC4O95801 387 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SDC4P31431 198 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TRIM32Q13049 653 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 RASA4BC9J798 803 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 MCF2LO15068 1137 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 RASA4O43374 803 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 MAP2K5Q13163 448 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SNX17Q15036 470 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 ACCSLQ4AC99 568 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 P3H4Q92791 437 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SGSM3Q96HU1 749 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 GAD1Q99259 594 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 WHRNQ9P202 907 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TP73O15350 636 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 KCNN4O15554 427 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 KRT7P08729 469 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 NEFHP12036 1026 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CFAP36Q96G28 342 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 BCO2Q9BYV7 579 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 NME7Q9Y5B8 376 aa14.53□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 CREB3O43889 395 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 HMGCRP04035 888 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 FGFR1P11362 822 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 MLH1P40692 756 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 TCEAL1Q15170 157 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 PALM2Q8IXS6 379 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 NOD1Q9Y239 953 aa14.52□□□□□ -0.08
TRIM4-201ENST00000349062 RASSF9O75901 435 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 POMCP01189 267 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms