RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SPOPLQ6IQ16 392 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RETSATQ6NUM9 610 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2U1Q7Z449 544 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SMARCD2Q92925 531 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MBOAT7Q96N66 472 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRJQ12913 1337 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 M0QYT0 321 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DFFAO00273 331 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN5O00501 218 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ACADSBP45954 432 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G4AP47712 749 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GAD2Q05329 585 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DPYDQ12882 1025 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 STK4Q13043 487 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 E2F4Q16254 413 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK18Q7Z418 384 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 WDR49Q8IV35 697 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LGI2Q8N0V4 545 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL6Q8N531 539 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FGF13Q92913 245 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EPAS1Q99814 870 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZWILCHQ9H900 591 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MTCH2Q9Y6C9 303 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM49BA6NDI0 452 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01565O15544 149 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GFRA3O60609 400 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF623O75123 536 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC130P13994 396 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PDGFRAP16234 1089 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 LILRA4P59901 499 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PDGFRLQ15198 375 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 MAN2A1Q16706 1144 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 EFHBQ8N7U6 833 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HSPH1Q92598 858 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 TMX1Q9H3N1 280 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.65□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 NBASA2RRP1 2371 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GRIN2DO15399 1336 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NOTCH2Q04721 2471 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM221A6NGB7 291 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 M0R296 226 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 BUB1O43683 1085 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HOXB2P14652 356 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2H1P32780 548 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SV2AQ7L0J3 742 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM32Q8TC27 787 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATP2A3Q93084 1043 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FAM84AQ96KN4 292 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TTC1Q99614 292 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GGT7Q9UJ14 662 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ARL2P36404 184 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEA1P43355 309 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 BCAT1P54687 386 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DYNLT1P63172 113 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 IRX4P78413 519 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KIF5AQ12840 1032 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MESDQ14696 234 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PON2Q15165 354 aa4.65□□□□□ -1.67
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