RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 OSCP1Q8WVF1 389 aa24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 TWNKQ96RR1 684 aa24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 MED10Q9BTT4 135 aa24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 LINC00597Q9H2U6 94 aa24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAPK13O15264 365 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 BEST1O76090 585 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIF20AO95235 890 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABL1P00519 1130 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 EGFP01133 1207 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 GJA4P35212 333 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 EML3Q32P44 896 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 C12orf29Q8N999 325 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZMIZ2Q8NF64 920 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 HINFPQ9BQA5 517 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 EPC1Q9H2F5 836 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 ECT2Q9H8V3 914 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT82Q9NSB4 513 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 LEFTY2O00292 366 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNFRSF10BO14763 440 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 OLFM2O95897 454 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 OAS1P00973 400 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 IFNAR2P48551 515 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 FNTBP49356 437 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAM9Q13443 819 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUP93Q8N1F7 819 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 RUBCNQ92622 972 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMOQ99835 787 aa24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 AP1G2O75843 785 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCF3P15923 654 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 YWHAQP27348 245 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRCPP42785 496 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 PGFP49763 221 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 GALK1P51570 392 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC5A3P53794 718 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 LPAL2Q16609 132 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 CPA6Q8N4T0 437 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAF4BQ92750 862 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNIP3Q96KP6 325 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 CPQQ9Y646 472 aa24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANTXRLA6NF34 631 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT13P13646 458 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 P4HA1P13674 534 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC7A9P82251 487 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEMA4DQ92854 862 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXO32Q969P5 355 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 EHD2Q9NZN4 543 aa24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP8B3O60423 1300 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUCB2P80303 420 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 GAB4Q2WGN9 574 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 WHAMMQ8TF30 809 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP2A3Q93084 1043 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 P2RY13Q9BPV8 354 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 GMIPQ9P107 970 aa24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNF40O75150 1001 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD58P19256 250 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADORA2BP29275 332 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP3K7CLP57077 242 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 INCA1Q0VD86 236 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP2R5DQ14738 602 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 UNC93AQ86WB7 457 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCSER2Q9H7U1 834 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL37Q9NZH6 218 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCDNQ9UBB6 729 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 COCHO43405 550 aa24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 HRO43593 1189 aa24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF25-201ENST00000348333 PFKLP17858 780 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms