RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.94■□□□□ 0.3
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SH3BP4-201ENST00000344528 LGALS2P05162 132 aa16.92■□□□□ 0.3
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SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 TIMM44O43615 452 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 PAEPP09466 180 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK16Q96T55 309 aa16.92■□□□□ 0.3
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