RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CCDC62Q6P9F0 684 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 TFAP2BQ92481 460 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SLCO2A1Q92959 643 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ITFG2Q969R8 447 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 FAM161BQ96MY7 647 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CYTH2Q99418 400 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 F8VP50 259 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 GSC2O15499 205 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 NEK3P51956 506 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 RTP1P59025 263 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 USP4Q13107 963 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 NR1H3Q13133 447 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TRPC3Q13507 836 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 AFG1LQ8WV93 481 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 IFT43Q96FT9 208 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 SYNCQ9H7C4 482 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 AKT3Q9Y243 479 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 GPR25O00155 361 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TOM1L1O75674 476 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ZWINTO95229 277 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 BAG2O95816 211 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 SERPINB3P29508 390 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 CFAP157Q5JU67 520 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 SAR1AQ9NR31 198 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 CISHQ9NSE2 258 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 MCL1Q07820 350 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 MAMLD1Q13495 774 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ARMCX2Q7L311 632 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 KBTBD2Q8IY47 623 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 BBOF1Q8ND07 529 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 NDNQ99608 321 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TTC1Q99614 292 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 PDP2Q9P2J9 529 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 MTA2O94776 668 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TGFB3P10600 412 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 AP1B1Q10567 949 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 NSL1Q96IY1 281 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 VCX3BQ9H321 246 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 EURLQ9NYK6 297 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ARMCX1Q9P291 453 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 PARP14Q460N5 1801 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 PMM2O15305 246 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 CREB3O43889 395 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 NFICP08651 508 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 AMPD1P23109 780 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 GCAP28676 217 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 ADORA2AP29274 412 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC27-201ENST00000317907 PGM1P36871 562 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms