RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 CDH8P55286 799 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SLC7A9P82251 487 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ARHGAP8P85298 464 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 LPAL2Q16609 132 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 FBXO32Q969P5 355 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF292O60281 2723 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 LEFTY2O00292 366 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 LRP3O75074 770 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 VNN1O95497 513 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 EGFP01133 1207 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 NR2F2P24468 414 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 PIK3CAP42336 1068 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 RAP1GAPP47736 663 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 VAMP7P51809 220 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 DMWDQ09019 674 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 NFIL3Q16649 462 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 SV2AQ7L0J3 742 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 FAM35AQ86V20 835 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CHFRQ96EP1 664 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CPQQ9Y646 472 aa21.45■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 HRO43593 1189 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CACNA2D1P54289 1103 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 DLG4P78352 724 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 DPYDQ12882 1025 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 UNC93AQ86WB7 457 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ACDQ96AP0 544 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 COMMD8Q9NX08 183 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 AP1G2O75843 785 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 OLFM2O95897 454 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 PRR29P0C7W0 189 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ENPEPQ07075 957 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ACOT1Q86TX2 421 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 OBSL1O75147 1896 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF202O95125 648 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 HLA-DRAP01903 254 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 SLC5A3P53794 718 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 BECN1Q14457 450 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 HECTD3Q5T447 861 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 KCNK16Q96T55 309 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 RNF38Q9H0F5 515 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 SDCBP2Q9H190 292 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 KRT82Q9NSB4 513 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 NDST1P52848 882 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 SPEM2Q0P670 501 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ADAM9Q13443 819 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 FUKQ8N0W3 1084 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 NACA2Q9H009 215 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 AKAP3O75969 853 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ADH1CP00326 375 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC192P0DO97 292 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 TUBP50607 506 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ZXDBP98169 803 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 SYT13Q7L8C5 426 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms