RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298282.13

PKNOX2-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX2, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-201ENST00000298282 KCNJ1P48048 391 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LMNB2Q03252 620 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MUM1Q2TAK8 710 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TRIM50Q86XT4 487 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ERP27Q96DN0 273 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ASB7Q9H672 318 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 GAS8O95995 478 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 IQCF3P0C7M6 154 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 RALAP11233 206 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TNFAIP2Q03169 654 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SEZ6Q53EL9 994 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PPTC7Q8NI37 304 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TFAP2BQ92481 460 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 O00370 1275 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TBX10O75333 385 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CETPP11597 493 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SERPINB12Q96P63 405 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PHF12Q96QT6 1004 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MORF4L1Q9UBU8 362 aa11.16□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TNNC2P02585 160 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CALCOCO2Q13137 446 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LSAMPQ13449 338 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ZBTB33Q86T24 672 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM221A6NGB7 291 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SUN1O94901 812 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 OGDHQ02218 1023 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 IRF5Q13568 498 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ACAP1Q15027 740 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 DBN1Q16643 649 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF699Q32M78 642 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PASD1Q8IV76 773 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC89Q8N998 374 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 EURLQ9NYK6 297 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MED7O43513 233 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LIASO43766 372 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ABHD2P08910 425 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PHKA2P46019 1235 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 INCA1Q0VD86 236 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SNAPC2Q13487 334 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ARMCX2Q7L311 632 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 HAPLN3Q96S86 360 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 RNF181Q9P0P0 153 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.15□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 GPR25O00155 361 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 NDC80O14777 642 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TTC4O95801 387 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 LGALS2P05162 132 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 CD151P48509 253 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 TRPC3Q13507 836 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 COPS5Q92905 334 aa11.14□□□□□ -0.63
PKNOX2-201ENST00000298282 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms