RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297784.9

TMC1-201, Transcript of transmembrane channel like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMC1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1-201ENST00000297784 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 RSPH3Q86UC2 560 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 FAM136AQ96C01 138 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 VWCEQ96DN2 955 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ZFP42Q96MM3 310 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 NT5C1BQ96P26 610 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TRIM4Q9C037 500 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 MIOSQ9NXC5 875 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 KBTBD13C9JR72 458 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 NBNO60934 754 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 SHBGP04278 402 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CFHP08603 1231 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CUL2Q13617 745 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 SURF1Q15526 300 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ASIC2Q16515 512 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 LPPQ93052 612 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ARMC5Q96C12 935 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 SDCBP2Q9H190 292 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CHST12Q9NRB3 414 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 AMACRQ9UHK6 382 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 M0QZ92 97 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 GPR182O15218 404 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TTI1O43156 1089 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TUBP50607 506 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 DNA2P51530 1060 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 MFAP3P55082 362 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 FAAP100Q0VG06 881 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 KYAT1Q16773 422 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 APOL6Q9BWW8 343 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 DPP3Q9NY33 737 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 NAGPAQ9UK23 515 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 POLIQ9UNA4 740 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 NME7Q9Y5B8 376 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.99□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 FAM170AA1A519 330 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 PYGLP06737 847 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 KCNE1P15382 129 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CYP11B1P15538 503 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 PCK1P35558 622 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ZNF132P52740 706 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 PPARDQ03181 441 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CLUL1Q15846 466 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TRIM74Q86UV6 250 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TRIM73Q86UV7 250 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 FITM2Q8N6M3 262 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 INPP5DQ92835 1189 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 KIF12Q96FN5 646 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 ERP44Q9BS26 406 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 BCO2Q9BYV7 579 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 PIDD1Q9HB75 910 aa6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
TMC1-201ENST00000297784 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms