RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 HESX1Q9UBX0 185 aa25.08■■□□□ 1.61
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TRIM54-201ENST00000296098 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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TRIM54-201ENST00000296098 APOL6Q9BWW8 343 aa25.06■■□□□ 1.6
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC6A3Q01959 620 aa25.05■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 ROR1Q01973 937 aa25.05■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 MAP2K5Q13163 448 aa25.05■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 KRT81Q14533 505 aa25.05■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 FAM71DQ8N9W8 422 aa25.05■■□□□ 1.6
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TRIM54-201ENST00000296098 CAPN12Q6ZSI9 719 aa25.05■■□□□ 1.6
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TRIM54-201ENST00000296098 TAX1BP1Q86VP1 789 aa25.05■■□□□ 1.6
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TRIM54-201ENST00000296098 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.05■■□□□ 1.6
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TRIM54-201ENST00000296098 STK32AQ8WU08 396 aa25.03■■□□□ 1.6
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TRIM54-201ENST00000296098 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 GJD2Q9UKL4 321 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa25.03■■□□□ 1.6
TRIM54-201ENST00000296098 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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