RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 LMO3Q8TAP4 145 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 RNF34Q969K3 372 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SGF29Q96ES7 293 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 GPC4O75487 556 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 MT-CO1P00395 513 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TAF5Q15542 800 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF333Q96JL9 665 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ACTL7BQ9Y614 415 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TAF1P21675 1872 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ALOX15BO15296 676 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 F7P08709 466 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 RAG1P15918 1043 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 NUMBP49757 651 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 MSS51Q4VC12 460 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 APOPT1Q96IL0 206 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 MIPEPQ99797 713 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 COMMD10Q9Y6G5 202 aa15.04■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TPST1O60507 370 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 PYGLP06737 847 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 GCNT1Q02742 428 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 GRIK3Q13003 919 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ATG4CQ96DT6 458 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SERAC1Q96JX3 654 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 POLIQ9UNA4 740 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TM9SF1O15321 606 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 LYNP07948 512 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 CCNB1P14635 433 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SFNP31947 248 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 PKNOX1P55347 436 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 GTF2BQ00403 316 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ITGA9Q13797 1035 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 EXT2Q93063 718 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 NDNQ99608 321 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 APOL2Q9BQE5 337 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 CAAP1Q9H8G2 361 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF302Q9NR11 478 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 FZD1Q9UP38 647 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0B4J269 797 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 MED7O43513 233 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 LDHAP00338 332 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 GLRBP48167 497 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.03■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 E7ENQ6 273 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SDC4P31431 198 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF677Q86XU0 584 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 CPT1BQ92523 772 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 OPTNQ96CV9 577 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 PHF12Q96QT6 1004 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.02■□□□□ -0
PTPRN-201ENST00000295718 TBC1D12O60347 775 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 UGT1A9O60656 530 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RBL1P28749 1068 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CASP2P42575 452 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ACVR2BQ13705 512 aa15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms