RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 PIRO00625 290 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CYB561D2O14569 222 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 LIASO43766 372 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 MGEA5O60502 916 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 HUS1O60921 280 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 PPFIA2O75334 1257 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 TJP3O95049 919 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 KDELR1P24390 212 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 YY1P25490 414 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CETN2P41208 172 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 SEC24CP53992 1094 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 KYAT1Q16773 422 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CCDC14Q49A88 953 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 ADGRF2Q8IZF7 708 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 ART4Q93070 314 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CAPS2Q9BXY5 557 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 TMBIM4Q9HC24 238 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.66□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 GPD1P21695 349 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 TAF6P49848 677 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CCNG2Q16589 344 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 ADAM32Q8TC27 787 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 SNF8Q96H20 258 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 PADI3Q9ULW8 664 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 SEPT4O43236 478 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CLUL1Q15846 466 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 ZSCAN26Q16670 478 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 LRRC31Q6UY01 552 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 CD302Q8IX05 232 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 FAM71DQ8N9W8 422 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 SLC35F5Q8WV83 523 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 KCNK16Q96T55 309 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 MED10Q9BTT4 135 aa10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PSME3-201ENST00000293362 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 IRAK1P51617 712 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 GJA9P57773 515 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 OLFML1Q6UWY5 402 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 LEKR1Q6ZMV7 388 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TXLNGYQ9BZA5 131 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MLXIPLQ9NP71 852 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CDH23Q9H251 3354 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ARL5CA6NH57 179 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RIPK2O43353 540 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PRPSAP2O60256 369 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MAN1A1P33908 653 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 BRCC3P46736 316 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TM4SF4P48230 202 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MAP3K7CLP57077 242 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CDC42EP1Q00587 391 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 FAXCQ5TGI0 409 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 AGMOQ6ZNB7 445 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 UNC45BQ8IWX7 931 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PYROXD2Q8N2H3 581 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 STKLD1Q8NE28 680 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RSPH14Q9UHP6 348 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CD4P01730 458 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CREB1P16220 341 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SDC4P31431 198 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ACTN2P35609 894 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DRG2P55039 364 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SP3Q02447 781 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ADIGQ0VDE8 80 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MTMR3Q13615 1198 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KRT81Q14533 505 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PIGZQ86VD9 579 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 FAM131BQ86XD5 332 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ADAM2Q99965 735 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SELENOSQ9BQE4 189 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms