RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 SLC9A9Q8IVB4 645 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM247A6NEH6 219 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CYTH1Q15438 398 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ACCSLQ4AC99 568 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC40Q9H9A6 602 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 SLC13A4Q9UKG4 626 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 HMOX2P30519 316 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ELMOD1Q8N336 334 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 USP20Q9Y2K6 914 aa18.26■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 PMPCBO75439 489 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 KCTD10Q9H3F6 313 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TAS2R14Q9NYV8 317 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 RICTORQ6R327 1708 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 SYF2O95926 243 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 DLG4P78352 724 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 OCA2Q04671 838 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM154Q6P9G4 183 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CHST7Q9NS84 486 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TIMM44O43615 452 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 PYGLP06737 847 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CPT1AP50416 773 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 GTF2BQ00403 316 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 FAM83EQ2M2I3 478 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 IL31Q6EBC2 164 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 MREGQ8N565 214 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TBCBQ99426 244 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 HSD17B14Q9BPX1 270 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC90BQ9GZT6 254 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TMCC1O94876 653 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 MYBL2P10244 700 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ACKR2O00590 384 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 DNAJC6O75061 913 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 B3GAT3O94766 335 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CNTFP26441 200 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 IFNEQ86WN2 208 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ASB7Q9H672 318 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 PPATQ06203 517 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 SGF29Q96ES7 293 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 DNPEPQ9ULA0 475 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 H3BRB1 525 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 INSRRP14616 1297 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 RCN1Q15293 331 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CPB2Q96IY4 423 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 WDR18Q9BV38 432 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC134Q9H6E4 229 aa18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TTMPQ5BVD1 217 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TTC23LQ6PF05 361 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 VSIG10LQ86VR7 867 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF197O14709 1029 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 MYO1DO94832 1006 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ELK3P41970 407 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 FOXR1Q6PIV2 292 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CHSY1Q86X52 802 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 DCLRE1BQ9H816 532 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TSPAN16Q9UKR8 245 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 AKAP10O43572 662 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 CALB2P22676 271 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 TGFB2P61812 414 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 NFIL3Q16649 462 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 EFHBQ8N7U6 833 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.23■□□□□ 0.51
SCARB2-201ENST00000264896 ACADSP16219 412 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms