RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PDCLQ13371 301 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DUPD1Q68J44 220 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 GCNAQ96QF7 691 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SH3GL3Q99963 347 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MYO7AQ13402 2215 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ITGA8P53708 1063 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ROR1Q01973 937 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 P3H1Q32P28 736 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CA12O43570 354 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 GJB6O95452 261 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 LCP1P13796 627 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 AKAP5P24588 427 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 LGSNQ5TDP6 509 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CERS4Q9HA82 394 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CILPO75339 1184 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 KRT10P13645 584 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PEX5P50542 639 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 EMC1Q8N766 993 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 F8VP50 259 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 GRAP2O75791 330 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ASPAP45381 313 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MORN1Q5T089 497 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ARL8AQ96BM9 186 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 FAM118BQ9BPY3 351 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.1□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 KPNA7A9QM74 516 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SMAPO00193 183 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 APOL1O14791 398 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 AGTP01019 485 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TMC7Q7Z402 723 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 POLNQ7Z5Q5 900 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 USP18Q9UMW8 372 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DYTNA2CJ06 578 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJB2P25686 324 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 STX2P32856 288 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TM4SF4P48230 202 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PPARDQ03181 441 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SLC29A2Q14542 456 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC14Q49A88 953 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SGSM3Q96HU1 749 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CABS1Q96KC9 395 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 KLC2Q9H0B6 622 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MSRAQ9UJ68 235 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 Q9Y3F1 56 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SKIP12755 728 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PROZP22891 400 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PCSK1P29120 753 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RAD23BP54727 409 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PTK6Q13882 451 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 STAT4Q14765 748 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SNX17Q15036 470 aa11.09□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms