RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216877.10

PTPRA-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRA, Length 3,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-201ENST00000216877 HIF1AQ16665 826 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CYP2A13Q16696 494 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GPR141Q7Z602 305 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PPM1NQ8N819 430 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NLRP7Q8WX94 980 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 A0A088AWK7 358 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GOLGA8TH3BQL2 631 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NOL3O60936 208 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GRM2Q14416 872 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 POMPQ9Y244 141 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MCF2P10911 925 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CCNIQ14094 377 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 EBF1Q9UH73 591 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CHMP2AO43633 222 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GCAP28676 217 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CYP1B1Q16678 543 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 EMSYQ7Z589 1322 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A9O60656 530 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CSPG5O95196 566 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A6P19224 532 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A1P22309 533 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A4P22310 534 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A3P35503 534 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A5P35504 534 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 BNIP3Q12983 259 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GRM4Q14833 912 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 BTBD19C9JJ37 291 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 FSCN2O14926 492 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ETFBP38117 255 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 16.4
PTPRA-201ENST00000216877 GNA12Q03113 381 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GAD2Q05329 585 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 FAAP100Q0VG06 881 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MYBPC2Q14324 1141 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MMP19Q99542 508 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PKNOX1P55347 436 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TRAF2Q12933 501 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ANO4Q32M45 955 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GPR107Q5VW38 600 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ATG16L1Q676U5 607 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF786Q8N393 782 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IRGQQ8WZA9 623 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 KCNN1Q92952 543 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 EHD1Q9H4M9 534 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 M0R2N6 131 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PDXKO00764 312 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 APOEP02649 317 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 FLOT2Q14254 428 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CFAP36Q96G28 342 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 BTBD9Q96Q07 612 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MTMR9Q96QG7 549 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 EPB41L1Q9H4G0 881 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CDH22Q9UJ99 828 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 DNPEPQ9ULA0 475 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRA-201ENST00000216877 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms