RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 STARP49675 285 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 FAM92AA1XBS5 289 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CYP2D6P10635 497 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 RXRGP48443 463 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 EFNA5P52803 228 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 RASA2Q15283 850 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 DYRK3O43781 588 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 NT5C2P49902 561 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 SEC24CP53992 1094 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 RHAGQ02094 409 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 FAM20AQ96MK3 541 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L15C9J2P7 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L11C9JVI0 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L18D6R9N7 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L22D6RA61 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L19D6RCP7 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L20D6RJB6 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ATG7O95352 703 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PDHBP11177 359 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ITGA3P26006 1051 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L24Q0WX57 530 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ERP44Q9BS26 406 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 MGAT4DA6NG13 374 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 FCER1AP12319 257 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 FMO5P49326 533 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 NAB2Q15742 525 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 USP33Q8TEY7 942 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 LCA5LO95447 670 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 EFHC1Q5JVL4 640 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 SETD9Q8NE22 299 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 GPC1P35052 558 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ACLYP53396 1101 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 OVGP1Q12889 678 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 NCOA4Q13772 614 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 IL31Q6EBC2 164 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 C4orf22Q6V702 233 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 KCNB2Q92953 911 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 A0A1B0GTH6 734 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 VPS26AO75436 327 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 EPS8Q12929 822 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ANKRD7Q92527 254 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ISCUQ9H1K1 167 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.57□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CHRM3P20309 590 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PAX7P23759 505 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CASP4P49662 377 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 DGKDQ16760 1214 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 LIN54Q6MZP7 749 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 OOSP2Q86WS3 158 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 WHRNQ9P202 907 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 TM9SF1O15321 606 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 BAIAP3O94812 1187 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 TSPAN19P0C672 248 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 PCNAP12004 261 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 ZNF614Q8N883 585 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 SLC9A7Q96T83 725 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 CHKBQ9Y259 395 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 TRAPPC3O43617 180 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 IDH3BO43837 385 aa9.56□□□□□ -0.88
TNS1-201ENST00000171887 LARGE1O95461 756 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms