RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Themis2Q91YX0 663 aa20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pard3bQ9CSB4 1203 aa20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fundc1Q9DB70 155 aa20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif26aQ52KG5 1881 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dock1Q8BUR4 1865 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ssxb9A2BI93 185 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpr161B2RPY5 545 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn2r84D3YWE3 849 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr731F8VQB9 326 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Acot1O55137 419 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sparcl1P70663 650 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf40Q3U319 1001 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trim38Q5SZ99 471 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt12Q64291 487 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stk40Q7TNL3 435 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem202Q80W35 275 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 OafQ8QZR4 282 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Plekhh3Q8VCE9 796 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trim60Q8VI40 466 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Alg1Q921Q3 482 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf135Q9CWS1 417 aa20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pate3B3GLJ3 98 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm8369E9PZI3 166 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 FancfE9Q5Z5 343 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Il27raO70394 623 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01652 108 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ephb4P54761 987 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dupd1Q8BK84 215 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc13a3Q91Y63 600 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mcur1Q9CXD6 340 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atg7Q9D906 698 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wfdc1Q9ESH5 211 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxo17Q9QZM8 286 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Apol7bB1AQP7 369 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Samd15F6XZJ7 620 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm7694J3QNH8 270 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mup5P11591 180 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 VcpQ01853 806 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam172aQ3TNH5 417 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pid1Q3UBG2 217 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Apol7eQ3UZ24 369 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adad1Q5SUE7 619 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dpysl3Q62188 570 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Txndc8Q69AB2 127 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpatch2lQ6PE65 482 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2q1Q7TSS2 422 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn2r43Q80Z08 845 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Apol7cQ8C6E1 369 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lrrc66Q8K0B3 872 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Prpf39Q8K2Z2 665 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pcdha10Q91Y20 946 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nek8Q91ZR4 698 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rec114Q9CWH4 259 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dgcr8Q9EQM6 773 aa20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dock3Q8CIQ7 2027 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pex10B1AUE5 324 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm3002E9PW72 216 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 C87414E9PWI7 475 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm6583E9Q8Z1 469 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp850J3QPC5 689 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myl1P05977 188 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Glb1P23780 647 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Uchl4P58321 233 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adamts1P97857 968 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 HmgcrQ01237 887 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bicd1Q8BR07 835 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pomgnt1Q91X88 660 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dhx58Q99J87 678 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tsnaxip1Q99P25 704 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam3aQ9D8T0 230 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tacc3Q9JJ11 631 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Foxe3Q9QY14 288 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm13128L7MU96 475 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fgf15O35622 218 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atf2P16951 487 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 B3gat3P58158 335 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf10Q3UIW5 804 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Skap2Q3UND0 358 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Itgbl1Q8VDV0 494 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1502Q8VG66 316 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cuedc2Q9CXX9 284 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc25a19Q9DAM5 318 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nme7Q9QXL8 395 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mapk13Q9Z1B7 366 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Diaph3Q9Z207 1171 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lonrf1D3YY23 762 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm3460E9QAI8 215 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 DsppP97399 934 aa20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ArvcfP98203 962 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.7 ms