RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TgdsQ8VDR7 355 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pomgnt1Q91X88 660 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmg1Q9JK23 289 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chrac1Q9JKP8 129 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col4a3Q9QZS0 1669 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pgap3A2A559 320 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C130060K24RikG3UWA8 416 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gsta4P24472 222 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmc1P62192 440 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh3bp2Q06649 559 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp953Q3UPV7 304 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp3a16Q64481 504 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BGA7 448 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem74Q8BQU7 305 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptrh1Q8BW00 204 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bri3bpQ8BXV2 253 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hdac7Q8C2B3 938 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mgat5Q8R4G6 740 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrbp2Q91V36 499 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpv6Q91WD2 767 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdha9Q91Y11 979 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TfQ921I1 697 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mageb3Q9D2H4 330 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gdap2Q9DBL2 498 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rfx5Q9JL61 658 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ror1Q9Z139 937 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Megf6Q80V70 1572 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rtl9Q32KG4 1339 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kpna7C0LLJ0 499 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apold1E9Q0X2 246 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r39L7N2E5 861 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpini1O35684 410 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 StrnO55106 780 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Schip1P0DPB4 484 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ThbdP15306 577 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspa1lP16627 641 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccnb1P24860 430 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Neurl1bQ0MW30 546 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q3UE31 404 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ffar3Q3UFD7 319 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psg28Q4KL66 472 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adamts18Q4VC17 1219 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Als2clQ60I26 952 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grid2Q61625 1007 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CbarpQ66L44 698 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IqceQ6PCQ0 778 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mical2Q8BML1 960 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gbp9Q8BTS3 619 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Azin2Q8BVM4 459 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syt15Q8C6N3 418 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tfb1mQ8JZM0 345 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpp40Q8R1F9 363 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pex19Q8VCI5 299 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgd4Q91ZT5 766 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tceal1Q921P9 165 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med10Q9CXU0 135 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gins2Q9D600 185 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmco5aQ9D9D5 303 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp5hQ9DCX2 161 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PorcnQ9JJJ7 461 aa6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4931406B18RikA2RSL7 367 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2t4E9PWV0 503 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Per2O54943 1257 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vti1aO89116 217 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myl1P05977 188 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gnl1P36916 607 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab6bP61294 208 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arid5aQ3U108 590 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map3k9Q3U1V8 1077 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Marveld2Q3UZP0 555 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xlr3aQ60595 226 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf185Q62394 352 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab34Q64008 259 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp16Q6PCP3 660 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cand2Q6ZQ73 1235 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc159Q8C963 411 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpc3Q8CFZ4 579 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smyd2Q8R5A0 433 aa6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.5 ms