RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)K

tK(UUU)K, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)K, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-DR1Q03856 440 aa2.25□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-GR2Q12485 440 aa2.25□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YPR014CQ6B0W2 109 aa2.25□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K PCL2P25693 308 aa2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K APS1P35181 156 aa2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.24□□□□□ -2.05not detected
tK(UUU)KtK(UUU)K YJR146WP47174 117 aa2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K NUP42P49686 430 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K HHO1P53551 258 aa2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K POR1P04840 283 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K SEC4P07560 215 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-DR6P0CX70 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-ER1P0CX71 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-LR2P0CX72 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-PLP0CX73 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-JR1P0CX74 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-LR3P0CX75 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-ML2P0CX76 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YEL008WP40001 126 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YER085CP40058 173 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YGL088WP53151 121 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YIL014C-AQ02598 104 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K PPT2Q12036 173 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-GR1Q12085 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K AQY1P0CD91 305 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YAL064WP39711 94 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K CYT2Q00873 224 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K ABF2Q02486 183 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YDR042CQ03205 200 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K CMC2Q3E7A4 109 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)KtK(UUU)K YAL065CO13511 128 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K QCR8P08525 94 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K HMRA2P0CY13 119 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K HAP3P13434 144 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K GSP1P32835 219 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K PET8P38921 284 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K NSE4P43124 402 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YFL067WP43537 175 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YFL019CP43576 117 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YMR295CQ03559 197 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YLR194CQ05777 254 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YLR307C-AQ3E825 87 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K ECM12O13529 151 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K STF1P01098 86 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K AQY2P0CD90 149 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K PRE1P22141 198 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K OXA1P39952 402 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K TPT1Q12272 230 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K ATP15P21306 62 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K TOA2P32774 122 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YKL070WP36087 169 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YBL081WP38180 368 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K SHU1P38751 150 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K COX14P39103 70 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K PEX22P39718 180 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K PEX17P40155 199 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K AIM19P40502 157 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K MMS2P53152 137 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YMR103CQ04436 120 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K CNL1Q06333 122 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K MBF1O14467 151 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YBR219CP38317 127 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K CWP2P43497 92 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K ARL3Q02804 198 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YLR112WQ12130 139 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K COA3Q3E7B2 85 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K Q0032Q9ZZX7 96 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YBL039W-BP0C268 59 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YJL197C-AP0C5P0 93 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YER039C-AP0CD97 72 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K CDC43P18898 376 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K GSP2P32836 220 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K PAU16P35994 123 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K MVB12P42939 101 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YML079WQ03629 201 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YML108WQ03759 105 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YPL261CQ08976 102 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K KTI11Q3E840 82 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YLR415CO13578 112 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K SMP1P38128 452 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K YER134CP40081 178 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K CGR1P53188 120 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K ATP16Q12165 160 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K COA6Q3E846 104 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K SCS22Q6Q595 175 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)KtK(UUU)K HYP2P23301 157 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 75.1 ms