RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	UBC5	P15732	148 aa		8.01	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	YJR146W	P47174	117 aa		8.01	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	YDL157C	Q12082	118 aa		8.01	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	BET5	Q03630	159 aa		8	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	NAT5	Q08689	176 aa		8	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	COA3	Q3E7B2	85 aa		8	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	TRP1	P00912	224 aa		7.99	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	MRP49	P32388	137 aa		7.99	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	SCS22	Q6Q595	175 aa		7.99	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	SAE3	P89114	91 aa		7.98	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	YKL070W	P36087	169 aa		7.97	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	YKL044W	P36092	106 aa		7.97	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	SCW10	Q04951	389 aa		7.97	□□□□□ -1.13
DDR2	YOL052C-A	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	AUA1	P32450	94 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	YPT53	P36019	220 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	CRC1	Q12289	327 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	HAL1	Q01766	294 aa		7.94	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		7.94	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	AIM29	P36154	155 aa		7.93	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	7.93	□□□□□ -1.14	not detected
DDR2	YOL052C-A	YBR209W	P38311	105 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	PAU23	Q07987	124 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	PAU17	Q12370	124 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	YIL059C	P40520	121 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	YPL261C	Q08976	102 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		7.9	□□□□□ -1.14
DDR2	YOL052C-A	YEL008W	P40001	126 aa		7.89	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	YGL088W	P53151	121 aa		7.89	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	ATP15	P21306	62 aa		7.88	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	YAR029W	P39549	74 aa		7.88	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	YPL073C	P40323	161 aa		7.88	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	SPC1	P46965	94 aa		7.88	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.87	□□□□□ -1.15	not detected
DDR2	YOL052C-A	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	GLC8	P41818	229 aa		7.87	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	AIM11	P87275	137 aa		7.87	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	YKR041W	P36134	250 aa		7.85	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	YLR194C	Q05777	254 aa		7.85	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	ERG28	P40030	148 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDR2	YOL052C-A	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		7.83	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		7.83	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	HAP3	P13434	144 aa		7.82	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	YGL015C	P33199	130 aa		7.82	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	PEX17	P40155	199 aa		7.82	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	IGO2	Q9P305	131 aa		7.82	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	SHU1	P38751	150 aa		7.81	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	YER085C	P40058	173 aa		7.81	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	YML079W	Q03629	201 aa		7.8	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		7.8	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	ENV10	Q99382	181 aa		7.8	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	CWC27	Q02770	301 aa		7.79	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	QCR8	P08525	94 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	RPR2	P40571	144 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	YMR295C	Q03559	197 aa		7.78	□□□□□ -1.16
DDR2	YOL052C-A	YBR219C	P38317	127 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	YEL067C	P39978	195 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	YNR077C	P53758	84 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	YMR320W	Q04897	101 aa		7.77	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	CIN5	P40917	295 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		7.76	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	RTC6	O14464	93 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	MRPS12	P53732	153 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	PPT2	Q12036	173 aa		7.75	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	ELC1	Q03071	99 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		7.74	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	COX14	P39103	70 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	OXA1	P39952	402 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	RPC10	P40422	70 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	PBA1	Q05778	276 aa		7.73	□□□□□ -1.17
DDR2	YOL052C-A	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	7.71	□□□□□ -1.18	not detected
DDR2	YOL052C-A	MHR1	Q06630	226 aa		7.71	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	DIF1	O13577	133 aa		7.7	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	UGX2	P32772	223 aa		7.7	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	TOA2	P32774	122 aa		7.7	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	YFR057W	P43625	151 aa		7.7	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	YDR115W	Q04598	105 aa		7.7	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	YDL241W	Q07738	123 aa		7.7	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	SVP26	P38869	228 aa		7.69	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	YAL065C	O13511	128 aa		7.68	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	UIP3	P39547	235 aa		7.68	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		7.67	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	YLR296W	Q05898	108 aa		7.66	□□□□□ -1.18

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