RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	CIS3	P47001	227 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	MPC3	P53311	146 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	ELP6	Q04868	273 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	COA6	Q3E846	104 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	SCS22	Q6Q595	175 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	ATG40	Q99325	256 aa		1.51	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	1.5	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	MSB2	P32334	1306 aa		1.5	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	TDA2	P40045	126 aa		1.5	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YER187W	P40102	141 aa		1.5	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	CYB5	P40312	120 aa		1.5	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	1.5	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	FLO1	P32768	1537 aa		1.5	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	PAU21	P0CE86	164 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	PAU22	P0CE87	164 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YCR085W	P25650	117 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YHL005C	P38752	130 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	HPA3	P39979	161 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	SWM2	P40342	146 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	EMC5	P40540	141 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	VMA21	P41806	77 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	BRP1	P53194	125 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YNR077C	P53758	84 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YDR042C	Q03205	200 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YML079W	Q03629	201 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YLR296W	Q05898	108 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YPR153W	Q06537	140 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YDL241W	Q07738	123 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	IRC19	Q07843	230 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	NAT5	Q08689	176 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	PRM3	Q08931	133 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YPR013C	Q12145	317 aa		1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	1.49	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	MDM35	O60200	86 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YHR213W	P0CI67	198 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	FUN14	P18411	198 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	MAK31	P23059	88 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YFL065C	P43539	102 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YPR203W	Q08994	102 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	ATG41	Q12048	136 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YDL157C	Q12082	118 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	1.48	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	RPL43B	P0CX26	92 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YHR022C	P38763	256 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YGR269W	P40326	108 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YIR020C	P40575	100 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	CYT2	Q00873	224 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	SEN15	Q04675	128 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YPL261C	Q08976	102 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	RRT15	Q3E811	62 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	OST5	Q92316	86 aa		1.47	□□□□□ -2.17
YLR224W	YLR224W	FLO9	P39712	1322 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	PAI3	P01094	68 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	INO4	P13902	151 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	TOM6	P33448	61 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	DSE2	P38844	325 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YHR180W	P38868	163 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	DCV1	P43595	202 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	MET31	Q03081	177 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YOR015W	Q12169	119 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	DAD1	Q12248	94 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	ENV10	Q99382	181 aa		1.46	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	RTC6	O14464	93 aa		1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	HSP10	P38910	106 aa		1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	CWP2	P43497	92 aa		1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	MHF1	Q3E835	90 aa		1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	TY4B-J	P47024	1803 aa		1.45	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YHL037C	P38733	133 aa		1.44	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	RSM18	P40033	138 aa		1.44	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		1.44	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	ICY1	Q04329	127 aa		1.44	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	UBR2	Q07963	1872 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YCL042W	P25572	119 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	HSP150	P32478	413 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	PAU2	P32612	120 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YBR027C	P38220	110 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YBR209W	P38311	105 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YEL014C	P39999	101 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	YFL051C	P43552	160 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	PAU12	P53343	120 aa		1.43	□□□□□ -2.18
YLR224W	YLR224W	AVO2	Q04749	426 aa		1.43	□□□□□ -2.18

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.2 ms