RNA–Protein interactions for RNA: YKR029C

SET3, Transcript of Defining member of the SET3 histone deacetylase complex, yeast

Gene SET3, Length 2,256 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET3	YKR029C	HHO1	P53551	258 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	IRC21	Q04772	201 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	MHF1	Q3E835	90 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	NHP10	Q03435	203 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
SET3	YKR029C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YJL009W	P47078	108 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	DIE2	P50076	525 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YGR039W	P53225	103 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	MGR2	Q02889	113 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	HOR7	Q05827	59 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	COX5B	P00425	151 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	ANB1	P19211	157 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	MRPL44	P19956	98 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YGR201C	P42936	225 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YNL019C	P53975	284 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	NAT5	Q08689	176 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YOR343C	Q12484	108 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	KTI11	Q3E840	82 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RIB3	Q99258	208 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	NMT1	P14743	455 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	FYV5	P25585	152 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	VPS55	P47111	140 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	SEN15	Q04675	128 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YMR320W	Q04897	101 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	SOM1	Q05676	74 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	FUN14	P18411	198 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YMR122C	Q03879	124 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	SPC3	Q12133	184 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	COA6	Q3E846	104 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	PFY1	P07274	126 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	TIM12	P32830	109 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	HHY1	P39982	102 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	PRM3	Q08931	133 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	SFT2	P38166	215 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YHR140W	P38842	239 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	LST8	P41318	303 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YFR035C	P43608	114 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	ROX3	P25046	220 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	COX12	Q01519	83 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YPL067C	Q02754	198 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YOR385W	Q08909	290 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YDR010C	Q12426	110 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YOS1	Q3E834	85 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	HAP3	P13434	144 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	QCR10	P37299	77 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	MPC2	P38857	129 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	YMR141C	P40211	102 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	BRP1	P53194	125 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	ATP14	Q12349	124 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	MED11	Q99278	115 aa		0.4	□□□□□ -2.34
SET3	YKR029C	HYM1	P32464	399 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YGR017W	P53210	297 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	ELC1	Q03071	99 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	SDH7	Q04401	133 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	COA4	Q05809	96 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YOL131W	Q08270	108 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.4	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	HSP10	P38910	106 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YGL149W	P53116	101 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	TOM7	P53507	60 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	SGF11	Q03067	99 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	RRT15	Q3E811	62 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	MHF2	Q3E829	80 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YCR050C	P25630	102 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	TRS20	P38334	175 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	HPM1	P40481	377 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YGR025W	P53216	100 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SET3	YKR029C	YLR296W	Q05898	108 aa		0.39	□□□□□ -2.35

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