RNA–Protein interactions for RNA: YKL056C

TMA19, Transcript of Protein that associates with ribosomes, yeastyeast

Gene TMA19, Length 504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA19YKL056C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.6□□□□□ -1.99not detected
TMA19YKL056C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C ATP23P53722 227 aa2.6□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C YIL014C-AQ02598 104 aa2.6□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C PKR1Q03880 122 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C DIF1O13577 133 aa2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C YKL044WP36092 106 aa2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C NRG2P38082 220 aa2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C SDH8P38345 138 aa2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C PET8P38921 284 aa2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C YER134CP40081 178 aa2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C YNL200CP40165 246 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C DPP1Q05521 289 aa2.59□□□□□ -1.99
TMA19YKL056C ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
TMA19YKL056C YJR146WP47174 117 aa2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C PPT2Q12036 173 aa2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C COA3Q3E7B2 85 aa2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C YIL134C-AQ45U18 67 aa2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C YPR014CQ6B0W2 109 aa2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C ENV10Q99382 181 aa2.58□□□□□ -2
TMA19YKL056C ATP5P09457 212 aa2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C HMRA2P0CY13 119 aa2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C YKL070WP36087 169 aa2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C YJL028WP47062 111 aa2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C YMR103CQ04436 120 aa2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C YLR112WQ12130 139 aa2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C TPT1Q12272 230 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C YMR175W-AQ3E766 64 aa2.57□□□□□ -2
TMA19YKL056C MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C RTC6O14464 93 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C RPL33AP05744 107 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C FUN14P18411 198 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C AIM29P36154 155 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C PEX17P40155 199 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C YIL059CP40520 121 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C HAC1P41546 238 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C BET5Q03630 159 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C YLR194CQ05777 254 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.56□□□□□ -2
TMA19YKL056C QCR8P08525 94 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C HAP3P13434 144 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C SEC11P15367 167 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C MRPL44P19956 98 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C PRE1P22141 198 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C YEL008WP40001 126 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C RPR2P40571 144 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C YGL230CP53074 147 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C CWC27Q02770 301 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C YML079WQ03629 201 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C YDL241WQ07738 123 aa2.55□□□□□ -2
TMA19YKL056C YLR415CO13578 112 aa2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C YBR209WP38311 105 aa2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C RPC10P40422 70 aa2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C SEN15Q04675 128 aa2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C PBA1Q05778 276 aa2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C PAU23Q07987 124 aa2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C PAU17Q12370 124 aa2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C SCS22Q6Q595 175 aa2.54□□□□□ -2
TMA19YKL056C YPT53P36019 220 aa2.53□□□□□ -2
TMA19YKL056C SHU1P38751 150 aa2.53□□□□□ -2
TMA19YKL056C AIM11P87275 137 aa2.53□□□□□ -2
TMA19YKL056C YDL157CQ12082 118 aa2.53□□□□□ -2
TMA19YKL056C YPL229WQ99395 206 aa2.53□□□□□ -2
TMA19YKL056C IGO2Q9P305 131 aa2.53□□□□□ -2
TMA19YKL056C ATP15P21306 62 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C SCM4P32564 187 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YKR041WP36134 250 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C COX14P39103 70 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YPL073CP40323 161 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C SAE3P89114 91 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YDR115WQ04598 105 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YMR320WQ04897 101 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa2.52□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C TOA2P32774 122 aa2.51□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YGL088WP53151 121 aa2.51□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YPL261CQ08976 102 aa2.51□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa2.51□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C MBF1O14467 151 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C RPF1P38805 295 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C SVP26P38869 228 aa2.5□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.5□□□□□ -2.01not detected
TMA19YKL056C YER085CP40058 173 aa2.5□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C CIN5P40917 295 aa2.5□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C GLC8P41818 229 aa2.5□□□□□ -2.01
TMA19YKL056C YMR295CQ03559 197 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.7 ms