RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	HMRA2	P0CY13	119 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	AIM29	P36154	155 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	COA6	Q3E846	104 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	TRP1	P00912	224 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	YLR112W	Q12130	139 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	PAU16	P35994	123 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	PBA1	Q05778	276 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	COA3	Q3E7B2	85 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	APS1	P35181	156 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	YMR103C	Q04436	120 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	CNL1	Q06333	122 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	RTC6	O14464	93 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	YEL008W	P40001	126 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	YER085C	P40058	173 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	DIF1	O13577	133 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	ERG28	P40030	148 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	YMR320W	Q04897	101 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	SVP26	P38869	228 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	YKL070W	P36087	169 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	SCS22	Q6Q595	175 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	ATP15	P21306	62 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	HAC1	P41546	238 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	YDR115W	Q04598	105 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	YAR029W	P39549	74 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	RRT15	Q3E811	62 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	SEC11	P15367	167 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	YBR219C	P38317	127 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	YPR195C	Q06594	109 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	ENV10	Q99382	181 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SPS100	YHR139C	FUN14	P18411	198 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YMR295C	Q03559	197 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YPL261C	Q08976	102 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YGL230C	P53074	147 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	AIM11	P87275	137 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YLR194C	Q05777	254 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.07	□□□□□ -1.44	not detected
SPS100	YHR139C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	CGR1	P53188	120 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	BET5	Q03630	159 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	MRPL44	P19956	98 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	RPC10	P40422	70 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YKL044W	P36092	106 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	SHU1	P38751	150 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YAL064W	P39711	94 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YDL157C	Q12082	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	FYV7	Q12247	151 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	ANB1	P19211	157 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YKR041W	P36134	250 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	NAT5	Q08689	176 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SPS100	YHR139C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	YCR007C	P25354	239 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	PEX17	P40155	199 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	YPL073C	P40323	161 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	YAL065C	O13511	128 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	COX14	P39103	70 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	CIN5	P40917	295 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	PPT2	Q12036	173 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	ATP5	P09457	212 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	SCM4	P32564	187 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	TOA2	P32774	122 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	YEL067C	P39978	195 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	GAT4	P40569	121 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	MRPS12	P53732	153 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	YDL241W	Q07738	123 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SPS100	YHR139C	MRP10	O75012	95 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	QCR8	P08525	94 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	5.96	□□□□□ -1.46	not detected
SPS100	YHR139C	IGO2	Q9P305	131 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	YNR077C	P53758	84 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	SNA2	P56508	79 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	YPL229W	Q99395	206 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	LCL2	Q08045	131 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	YDR029W	Q12111	104 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SPS100	YHR139C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.3 ms