RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	AIM34	Q03673	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	PAU23	Q07987	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	DGA1	Q08650	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	PAU17	Q12370	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	GLC8	P41818	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	TOS6	P48560	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	BET5	Q03630	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YCR007C	P25354	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YDR274C	P87283	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YKL070W	P36087	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	HAP3	P13434	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YJR146W	P47174	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YGL088W	P53151	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YKL044W	P36092	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YNL217W	P40152	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YBR209W	P38311	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YEL067C	P39978	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YPL073C	P40323	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YPS5	P53057	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YPL261C	Q08976	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	YCR001W	P25347	104 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YCH1	P42937	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	CWC27	Q02770	301 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	ATP15	P21306	62 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	AIM29	P36154	155 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	KRE9	P39005	276 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	UIP3	P39547	235 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	AIM11	P87275	137 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	DYN1	P36022	4092 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	NRG2	P38082	220 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	COX12	Q01519	83 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YKR041W	P36134	250 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
YCK1	YHR135C	YIL059C	P40520	121 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	UBC5	P15732	148 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YNR077C	P53758	84 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	PMP3	P87284	55 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	TRP1	P00912	224 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YEL008W	P40001	126 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YFR057W	P43625	151 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YER085C	P40058	173 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.46	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	OXA1	P39952	402 aa		4.46	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	CIN5	P40917	295 aa		4.46	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.46	□□□□□ -1.69
YCK1	YHR135C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.46	□□□□□ -1.7	not detected
YCK1	YHR135C	ELC1	Q03071	99 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	SCW10	Q04951	389 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YML079W	Q03629	201 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	MRP49	P32388	137 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	MRPS12	P53732	153 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YNL190W	P53872	204 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YLR194C	Q05777	254 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YBR219C	P38317	127 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YNL198C	P40166	100 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	MID2	P36027	376 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	SHU1	P38751	150 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	VAM10	Q08474	114 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	CRC1	Q12289	327 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	PEX17	P40155	199 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	SGF11	Q03067	99 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YMR295C	Q03559	197 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	PAI3	P01094	68 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	UGX2	P32772	223 aa		4.4	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	YLR296W	Q05898	108 aa		4.4	□□□□□ -1.7
YCK1	YHR135C	AUA1	P32450	94 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	YER181C	P40097	107 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	HAL1	Q01766	294 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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