RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C DGA1Q08650 418 aa1.57□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C PFY1P07274 126 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C UBC5P15732 148 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C PRE1P22141 198 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C GSP1P32835 219 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C GSP2P32836 220 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C SSS1P35179 80 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YKR070WP36151 352 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C SPC1P46965 94 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YGL118CP53132 145 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YIL014C-AQ02598 104 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C MGR2Q02889 113 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C ATP16Q12165 160 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YPR014CQ6B0W2 109 aa1.56□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C MRP49P32388 137 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YBR209WP38311 105 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data1.55□□□□□ -2.16 RIP-Chip
GCN4YEL009C YIL059CP40520 121 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YJR146WP47174 117 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C OST3P48439 350 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C TOS6P48560 102 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YGL088WP53151 121 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C POP3P53833 195 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C ERI1P62651 68 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C DPP1Q05521 289 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C CMC2Q3E7A4 109 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YOR008C-AQ3E7B9 74 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YMR122W-AQ3E842 84 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C HTL1Q9URQ5 78 aa1.55□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C DYN1P36022 4092 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C TRP1P00912 224 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C RPL33AP05744 107 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C HMRA2P0CY13 119 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C AIM29P36154 155 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YJL028WP47062 111 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C ERV14P53173 138 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YDR042CQ03205 200 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C PKR1Q03880 122 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C SEN15Q04675 128 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C COA3Q3E7B2 85 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C COA6Q3E846 104 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YIL134C-AQ45U18 67 aa1.54□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C RTC6O14464 93 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C APS1P35181 156 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C PAU16P35994 123 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C FYV4P38783 130 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C SVP26P38869 228 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YEL008WP40001 126 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C ERG28P40030 148 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YER085CP40058 173 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YMR103CQ04436 120 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YMR320WQ04897 101 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C RRT15Q3E811 62 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa1.53□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C ATP15P21306 62 aa1.52□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YKL070WP36087 169 aa1.52□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YDR115WQ04598 105 aa1.52□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C CNL1Q06333 122 aa1.52□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YPR195CQ06594 109 aa1.52□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C TPT1Q12272 230 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C SEC11P15367 167 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C FUN14P18411 198 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C ANB1P19211 157 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YBR219CP38317 127 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YAR029WP39549 74 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C HAC1P41546 238 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YGL230CP53074 147 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C AIM11P87275 137 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YMR295CQ03559 197 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C BET5Q03630 159 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YLR194CQ05777 254 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YPL261CQ08976 102 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C SCS22Q6Q595 175 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C ENV10Q99382 181 aa1.51□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YAR023CD6VPM8 179 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YDL022C-AP0C5L6 82 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C MRPL44P19956 98 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C SHU1P38751 150 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YAL064WP39711 94 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C PEX17P40155 199 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C RPC10P40422 70 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C CGR1P53188 120 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YMR175W-AQ3E766 64 aa1.5□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YDR034C-AP0C289 58 aa1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
GCN4YEL009C YKL044WP36092 106 aa1.49□□□□□ -2.17
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