RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	TRP1	P00912	224 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	Q0255	P03881	472 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	PEX17	P40155	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YCH1	P42937	148 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YJR146W	P47174	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	HOR7	Q05827	59 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	MSA1	Q08471	629 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	PRM7	Q12459	698 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	BPH1	P25356	2167 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	ATX1	P38636	73 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YGR025W	P53216	100 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	HPA2	Q06592	156 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YPR013C	Q12145	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	MRP10	O75012	95 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	CDC43	P18898	376 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	ATP15	P21306	62 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YER085C	P40058	173 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YER135C	P40082	130 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YFR057W	P43625	151 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	OST2	P46964	130 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	QCR8	P08525	94 aa		3.72	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.72	□□□□□ -1.81	not detected
UBX7	YBR273C	MRPS8	Q03799	155 aa		3.72	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YMR244W	Q04018	355 aa		3.72	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YLR042C	Q07990	161 aa		3.72	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	CAX4	P53223	239 aa		3.71	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	YNL092W	P53934	400 aa		3.71	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	SRL1	Q08673	210 aa		3.71	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		3.71	□□□□□ -1.81
UBX7	YBR273C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	UGX2	P32772	223 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	SHU1	P38751	150 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YAR029W	P39549	74 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	MIG3	P39943	394 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	VHS2	P40463	436 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	COX10	P21592	462 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YCR085W	P25650	117 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YHR130C	P38834	111 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RRT13	P40042	185 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	MRPS12	P53732	153 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	PMP3	P87284	55 aa		3.7	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	TRA1	P38811	3744 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	TEL1	P38110	2787 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	INO4	P13902	151 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YEL008W	P40001	126 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	SIM1	P40472	476 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	ALG13	P53178	202 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	EOS1	P53938	366 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	PPT2	Q12036	173 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	UBC5	P15732	148 aa		3.68	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	NRG2	P38082	220 aa		3.68	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	FIP1	P45976	327 aa		3.68	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.68	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.68	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		3.67	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	RPB9	P27999	122 aa		3.67	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YBR209W	P38311	105 aa		3.67	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YFL065C	P43539	102 aa		3.67	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YPR203W	Q08994	102 aa		3.67	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	TOR1	P35169	2470 aa		3.66	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	MPC2	P38857	129 aa		3.66	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YIA6	P40556	373 aa		3.66	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YNL190W	P53872	204 aa		3.66	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.66	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		3.66	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	NUM1	Q00402	2748 aa		3.66	□□□□□ -1.82
UBX7	YBR273C	YIL059C	P40520	121 aa		3.65	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YFR035C	P43608	114 aa		3.65	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YPS5	P53057	165 aa		3.65	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YGL088W	P53151	121 aa		3.65	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	ABF2	Q02486	183 aa		3.65	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.65	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	KRE1	P17260	313 aa		3.64	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	MID2	P36027	376 aa		3.64	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YCR041W	P37265	110 aa		3.64	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.64	□□□□□ -1.83	not detected
UBX7	YBR273C	HUR1	P45820	110 aa		3.64	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	RGM1	Q00453	211 aa		3.64	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		3.64	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	TOA2	P32774	122 aa		3.63	□□□□□ -1.83
UBX7	YBR273C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83

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