RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636481.1

CHRNA4-215, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, human

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 126 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHRNA4-215	ENST00000636481	SLC5A5	Q92911	643 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SKA1	Q96BD8	255 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SLC22A12	Q96S37	553 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	RIT2	Q99578	217 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	NUP58	Q9BVL2	599 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	C6orf50	Q9HD87	102 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	CASS4	Q9NQ75	786 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	DEC1	Q9P2X7	70 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SATB2	Q9UPW6	733 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	F5	P12259	2224 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ACACA	Q13085	2346 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	KAT6A	Q92794	2004 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481		A0A087WWV3	80 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	C2orf78	A6NCI8	922 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	WIPF3	A6NGB9	483 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	KCNJ18	B7U540	433 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	AGRP	O00253	132 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	LEFTY2	O00292	366 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ADAMTS3	O15072	1205 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	TRIM24	O15164	1050 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	OPA1	O60313	960 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SEMA7A	O75326	666 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	PSMD10	O75832	226 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	DDAH1	O94760	285 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	TNFSF15	O95150	251 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	LARGE1	O95461	756 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	CLDN1	O95832	211 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ADH1C	P00326	375 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ABL1	P00519	1130 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	C8B	P07358	591 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	NFIC	P08651	508 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	RNF224	P0DH78	156 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	CSH1	P0DML2	217 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	CSH2	P0DML3	217 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ADH5	P11766	374 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	MS4A1	P11836	297 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	ATF6	P18850	670 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SDS	P20132	328 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	GLRA2	P23416	452 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	GRIK1	P39086	918 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	GRIA4	P48058	902 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	GPR15	P49685	360 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	TPMT	P51580	245 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	NLRP5	P59047	1200 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	GAD2	Q05329	585 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	POU5F1B	Q06416	359 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	KCNAB2	Q13303	367 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	MYBPC2	Q14324	1141 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	STARD3	Q14849	445 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	GAB4	Q2WGN9	574 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	PROX2	Q3B8N5	592 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	HS1BP3	Q53T59	392 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	MANEA	Q5SRI9	462 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	C14orf80	Q86SX3	495 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	VASH2	Q86V25	355 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	MIB1	Q86YT6	1006 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CHRNA4-215	ENST00000636481	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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