RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617875.4

RECQL4-209, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RECQL4, Length 3,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-209ENST00000617875 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 FSCN2O14926 492 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 CALB2P22676 271 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 GTF2A2P52657 109 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 FSTL1Q12841 308 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 EXD1Q8NHP7 514 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 CENPTQ96BT3 561 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 MTBPQ96DY7 904 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 HPDLQ96IR7 371 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.68■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ZMPSTE24O75844 475 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 MT-CO1P00395 513 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ATP6V1B1P15313 513 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TAC1P20366 129 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 MIPP30301 263 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 NOMO3P69849 1222 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 CENPCQ03188 943 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 POU5F1BQ06416 359 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TFDP2Q14188 446 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 MTFR1Q15390 333 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 RNF220Q5VTB9 566 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 FAM13CQ8NE31 585 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TMC2Q8TDI7 906 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 STK32AQ8WU08 396 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 CDKL2Q92772 493 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 COL4A1P02462 1669 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 MAPTP10636 758 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ETS2P15036 469 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 KCNA4P22459 653 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 BAG6P46379 1132 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 SLC15A2Q16348 729 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 LRRC19Q9H756 370 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 USP18Q9UMW8 372 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TJP1Q07157 1748 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 HSPA4LO95757 839 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 23.7
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.67■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 OSBPP22059 807 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 VSTM1Q6UX27 236 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 PIGWQ7Z7B1 504 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TTC13Q8NBP0 860 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 NSL1Q96IY1 281 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 DPPA5A6NC42 116 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 KRT38O76015 456 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 GARTP22102 1010 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 SLC12A2P55011 1212 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 AQP5P55064 265 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 WNT7BP56706 349 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 GCNT1Q02742 428 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 NR1H3Q13133 447 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TMED1Q13445 227 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ZACNQ401N2 412 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF570Q96NI8 536 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 GLRBP48167 497 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 GDF10P55107 478 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 NFIL3Q16649 462 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 DCAF6Q58WW2 860 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.66■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 KCNK1O00180 336 aa16.65■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF286BP0CG31 522 aa16.65■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 RBL1P28749 1068 aa16.65■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 BNIP1Q12981 228 aa16.65■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 CUL3Q13618 768 aa16.65■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 PTK6Q13882 451 aa16.65■□□□□ 0.26
RECQL4-209ENST00000617875 TRIP10Q15642 601 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms