RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CPXCR1Q8N123 301 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 BANPQ8N9N5 519 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 FAF2Q96CS3 445 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CATSPER2Q96P56 530 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 KCNK13Q9HB14 408 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 BTBD7Q9P203 1132 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 STK24Q9Y6E0 443 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CLUHO75153 1309 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 TTC36A6NLP5 189 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 MTA2O94776 668 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 POLR2MP0CAP2 368 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 IMPDH2P12268 514 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 SHMT1P34896 483 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 RGS2P41220 211 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 ACOT2P49753 483 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 COPAP53621 1224 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 GDF10P55107 478 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 NADK2Q4G0N4 442 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 EFHC2Q5JST6 749 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 USP37Q86T82 979 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 EXD1Q8NHP7 514 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 APOPT1Q96IL0 206 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CSRNP1Q96S65 589 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 Q9H521 79 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 ATP8B3O60423 1300 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 WDR64B1ANS9 1081 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 PIK3R2O00459 728 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 NDC80O14777 642 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 NDUFB10O96000 172 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CYP3A7P24462 503 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CBX3Q13185 183 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 KRT81Q14533 505 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 KRT72Q14CN4 511 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 SEZ6Q53EL9 994 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 FAM182BQ5T319 152 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 LGSNQ5TDP6 509 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 DAW1Q8N136 415 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 ALLCQ8N6M5 410 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 HELQQ8TDG4 1101 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 TRIM11Q96F44 468 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 TCHPQ9BT92 498 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CYLDQ9NQC7 956 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 EURLQ9NYK6 297 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 TAF1P21675 1872 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CACNA1SQ13698 1873 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 F8W8V4 182 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 NEMP1O14524 444 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 MAGEC1O60732 1142 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 SNHG28P0DPA3 235 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 RBP3P10745 1247 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 PSMA2P25787 234 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CRABP2P29373 138 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 CIITAP33076 1130 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 NT5C2P49902 561 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 HPCAP84074 193 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 MAMLD1Q13495 774 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 PDK1Q15118 436 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-235ENST00000616247 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms