RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RBP3	P10745	1247 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GPX6	P59796	221 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MGAT5	Q09328	741 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SURF1	Q15526	300 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SLC1A5	Q15758	541 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FGD4	Q96M96	766 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341		A8MUI8	341 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MED7	O43513	233 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PYGL	P06737	847 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ITGAV	P06756	1048 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	KRT7	P08729	469 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CDH6	P55285	790 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NCALD	P61601	193 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	HHAT	Q5VTY9	493 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FZD8	Q9H461	694 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ALOX15B	O15296	676 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	B4GALT4	O60513	344 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CNMD	O75829	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM63A	O94886	807 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	COPS2	P61201	443 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TAP1	Q03518	808 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	AVIL	O75366	819 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	EURL	Q9NYK6	297 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CLUH	O75153	1309 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CYP2C8	P10632	490 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ARL4C	P56559	192 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GPC2	Q8N158	579 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	LCT	P09848	1927 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341		E5RJQ4	531 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341		H7C0C1	242 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MCF2L	O15068	1137 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ATP6V1G2	O95670	118 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ASMTL	O95671	621 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ABHD2	P08910	425 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PROZ	P22891	400 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ATP5O	P48047	213 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NDST1	P52848	882 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	EVPL	Q92817	2033 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	OVGP1	Q12889	678 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GRM1	Q13255	1194 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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