RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612286.4

HOXA3-207, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA3, Length 3,396 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-207ENST00000612286 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 OGFOD1Q8N543 542 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CEP120Q8N960 986 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 NDE1Q9NXR1 346 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ETAA1Q9NY74 926 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RIPK3Q9Y572 518 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 WDR64B1ANS9 1081 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TRPC3Q13507 836 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TFAP2BQ92481 460 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 INPP5DQ92835 1189 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 EBF3Q9H4W6 596 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 KRT82Q9NSB4 513 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 KCNN4O15554 427 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MTA2O94776 668 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ACVR2BQ13705 512 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 DLGAP5Q15398 846 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 DACT2Q5SW24 774 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SPATA31D3P0C874 917 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PHKA2P46019 1235 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CDH6P55285 790 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CDK16Q00536 496 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PRKCEQ02156 737 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PAOXQ6QHF9 649 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 NEMP1O14524 444 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 KRT3P12035 628 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GRIA1P42261 906 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MCL1Q07820 350 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TRIP10Q15642 601 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ADAM32Q8TC27 787 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 TTC25Q96NG3 672 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RIT2Q99578 217 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 STRA6Q9BX79 667 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GINS2Q9Y248 185 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ALOX15BO15296 676 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 P4HA2O15460 535 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 RTP1P59025 263 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ASPHQ12797 758 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 PSTPIP1O43586 416 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 ZWINTO95229 277 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-207ENST00000612286 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-207ENST00000612286 MORF4L2Q15014 288 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-207ENST00000612286 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-207ENST00000612286 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-207ENST00000612286 GCNAQ96QF7 691 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-207ENST00000612286 PANX3Q96QZ0 392 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-207ENST00000612286 IWS1Q96ST2 819 aa14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms