RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392		F8W810	466 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392		I3L4J1	428 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MBTPS2	O43462	519 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MICAL2	O94851	1124 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CXCL14	O95715	111 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SOD2	P04179	222 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CALB1	P05937	261 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CFH	P08603	1231 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	BCAT1	P54687	386 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SLC8A3	P57103	927 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TSPY1	Q01534	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GJD3	Q8N144	294 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MTA2	O94776	668 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CALCA	P01258	141 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CYP1A2	P05177	515 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CTSA	P10619	480 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ACADSB	P45954	432 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PTP4A2	Q12974	167 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	NAA35	Q5VZE5	725 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CASP10	Q92851	521 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	NCAN	O14594	1321 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392		M0QYV0	167 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ATP2C2	O75185	946 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	UROD	P06132	367 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SCNN1A	P37088	669 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DSG1	Q02413	1049 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ZP2	Q05996	745 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GPR17	Q13304	367 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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