RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601357.6

SSBP4-209, Transcript of single stranded DNA binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SSBP4, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4-209ENST00000601357 USP4Q13107 963 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 RUNX3Q13761 415 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 CCINQ13939 588 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 LRRC32Q14392 662 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ZNF77Q15935 545 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 TRIM68Q6AZZ1 485 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SV2AQ7L0J3 742 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SDCBP2Q9H190 292 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 TRPC7Q9HCX4 862 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.13■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 AKAP3O75969 853 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 TCF3P15923 654 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 NR2F2P24468 414 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 RAP1GAPP47736 663 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 CCR3P51677 355 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 BECN1Q14457 450 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PON2Q15165 354 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 DGKKQ5KSL6 1271 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SPEM1Q8N4L4 309 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 TAF4BQ92750 862 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 EBF3Q9H4W6 596 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 EHD2Q9NZN4 543 aa24.12■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 CLDN5O00501 218 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ASS1P00966 412 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 CKMP06732 381 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PFKLP17858 780 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 MTF1Q14872 753 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PDGFRLQ15198 375 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 Q6ZS52 159 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.11■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 DMXL1Q9Y485 3027 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ARSAP15289 507 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PPP3CCP48454 512 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 VAMP7P51809 220 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ENPEPQ07075 957 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 TNIP3Q96KP6 325 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.1■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ZNF840PA6NDX5 716 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 OLFM2O95897 454 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 P4HA1P13674 534 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 HDCP19113 662 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ASPAP45381 313 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 CXCL12P48061 93 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PDE6CP51160 858 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ZXDBP98169 803 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SATB1Q01826 763 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PPP2R5DQ14738 602 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 TMEM196Q5HYL7 178 aa24.09■■□□□ 1.45
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SSBP4-209ENST00000601357 OSCP1Q8WVF1 389 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 EPC1Q9H2F5 836 aa24.09■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 HLA-DRAP01903 254 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 NRLP54845 237 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 NUCB2P80303 420 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 PPP3CAQ08209 521 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 FAM35AQ86V20 835 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa24.08■■□□□ 1.45
SSBP4-209ENST00000601357 OAS1P00973 400 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 TRIM49P0CI25 452 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 TRIM49CP0CI26 452 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 PIK3CAP42336 1068 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 TAF10Q12962 218 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 ADAM9Q13443 819 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 PNOCQ13519 176 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 FUKQ8N0W3 1084 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 NUP93Q8N1F7 819 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 RUBCNQ92622 972 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 KCNK16Q96T55 309 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 HMGXB4Q9UGU5 601 aa24.07■■□□□ 1.44
SSBP4-209ENST00000601357 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.07■■□□□ 1.44
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