RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597782.5

TIMM50-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-210ENST00000597782 DPEP3Q9H4B8 488 aa17.87■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 TRPC7Q9HCX4 862 aa17.87■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DMAC2Q9NW81 257 aa17.87■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa17.87■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DENND4CQ5VZ89 1909 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DCDC2BA2VCK2 349 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 K7ESF4 209 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 HRO43593 1189 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 TACC1O75410 805 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 TADA3O75528 432 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 NOL4O94818 638 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 F11P03951 625 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 CCDC192P0DO97 292 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 ANXA13P27216 316 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 HOXA6P31267 233 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 ATICP31939 592 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 GRIK1P39086 918 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 RAP1GAPP47736 663 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 AP3M2P53677 418 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DLG4P78352 724 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 NUCB2P80303 420 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DMWDQ09019 674 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 NCOA4Q13772 614 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 CSRP2Q16527 193 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 TXNDC8Q6A555 127 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 MON1AQ86VX9 555 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 WDR5BQ86VZ2 330 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 CPA6Q8N4T0 437 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 PCED1BQ96HM7 432 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 XYLT2Q9H1B5 865 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 EBF3Q9H4W6 596 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 NME7Q9Y5B8 376 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 NCOR2Q9Y618 2525 aa17.86■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 A8MXQ7 604 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 STAU1O95793 577 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 CKMP06732 381 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 TGM1P22735 817 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 PTPRDP23468 1912 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 NR2F2P24468 414 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 MAGEA11P43364 429 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF667Q5HYK9 610 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 PRR23CQ6ZRP0 262 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 CCL26Q9Y258 94 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 FRYLO94915 3013 aa17.85■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DMXL1Q9Y485 3027 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 SLC30A4O14863 429 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 USP17L7P0C7H9 530 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DRD1P21728 446 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 KCNA4P22459 653 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 PIK3CAP42336 1068 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 IFNAR2P48551 515 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 PDE6CP51160 858 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 NR1H3Q13133 447 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 PNOCQ13519 176 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 KCNB1Q14721 858 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 IL31Q6EBC2 164 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 VSTM1Q6UX27 236 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 FAM83CQ9BQN1 747 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.457e-6■■■■■ 74.5
TIMM50-210ENST00000597782 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMM50-210ENST00000597782 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 TRIM66O15016 1216 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 RPP40O75818 363 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 VNN1O95497 513 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 TRIM49P0CI25 452 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 TRIM49CP0CI26 452 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 CDH8P55286 799 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 CLDN10P78369 228 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 MTF1Q14872 753 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 FBXO43Q4G163 708 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 TMEM196Q5HYL7 178 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 CCDC26Q8TAB7 109 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 TMEM174Q8WUU8 243 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 GAB3Q8WWW8 586 aa17.83■□□□□ 0.44
TIMM50-210ENST00000597782 ATP2A3Q93084 1043 aa17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms