RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591971.5

PDE4A-208, Transcript of phosphodiesterase 4A, human

TSL 5

Gene PDE4A, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4A-208	ENST00000591971	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PDXK	O00764	312 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	NCAM2	O15394	837 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	EXOC3	O60645	756 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CCIN	Q13939	588 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF77	Q15935	545 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MSANTD3	Q96H12	275 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CLDN5	O00501	218 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	DPYSL4	O14531	572 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PSMA7	O14818	248 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ATIC	P31939	592 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CDH8	P55286	799 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	SATB1	Q01826	763 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	USP4	Q13107	963 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MORC3	Q14149	939 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	NFIL3	Q16649	462 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ZACN	Q401N2	412 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971		Q6ZS52	159 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TSG101	Q99816	390 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971		K7ESF4	209 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CAVIN2	O95810	425 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	NR3C1	P04150	777 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ARSA	P15289	507 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TCF3	P15923	654 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	DMWD	Q09019	674 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PON2	Q15165	354 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971		F8VP50	259 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	BIN1	O00499	593 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	AKAP3	O75969	853 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	OLFM2	O95897	454 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TGM1	P22735	817 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	AVPR1A	P37288	418 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	RUNX3	Q13761	415 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	NCOA4	Q13772	614 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	TAF12	Q16514	161 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	STX1A	Q16623	288 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4A-208	ENST00000591971	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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