RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589419.1

CCBE1-204, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

TSL 4

Gene CCBE1, Length 587 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-204ENST00000589419 RAD9AQ99638 391 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-204ENST00000589419 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-204ENST00000589419 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-204ENST00000589419 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-204ENST00000589419 AMFRQ9UKV5 643 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-204ENST00000589419 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-204ENST00000589419 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.59□□□□□ -0.07
CCBE1-204ENST00000589419 FAM170AA1A519 330 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 TULP2O00295 520 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 PROSCO94903 275 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 FBXO21O94952 628 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 FTCDO95954 541 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 KRT3P12035 628 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 MAGEA11P43364 429 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 GLUD2P49448 558 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 RGS7P49802 495 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SLC6A3Q01959 620 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 DSG1Q02413 1049 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 VSTM1Q6UX27 236 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 ARCQ7LC44 396 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CEP57Q86XR8 500 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 MCEEQ96PE7 176 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM209Q96SK2 561 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SMOQ99835 787 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 TLR10Q9BXR5 811 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SNX12Q9UMY4 172 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.58□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CES2O00748 559 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 ENC1O14682 589 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 TRIM66O15016 1216 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 LINC00271P0C7V0 271 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CTNNA2P26232 953 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 MAP3K7CLP57077 242 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CREMQ03060 361 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 GPR17Q13304 367 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 MESDQ14696 234 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 RPS6KA1Q15418 735 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 PSMD5Q16401 504 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 RAB41Q5JT25 222 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SCML4Q8N228 414 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 HES6Q96HZ4 224 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CDC23Q9UJX2 597 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 ALG6Q9Y672 507 aa14.57□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 HHLA1C9JL84 531 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 DPYSL4O14531 572 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 SPOPO43791 374 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 TLL1O43897 1013 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 GABBR2O75899 941 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 BEST1O76090 585 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 URODP06132 367 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 GLI1P08151 1106 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CPB1P15086 417 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 COMTP21964 271 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 KRT17Q04695 432 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 ADIGQ0VDE8 80 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 ACAP1Q15027 740 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 IRGQQ8WZA9 623 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 CD101Q93033 1021 aa14.56□□□□□ -0.08
CCBE1-204ENST00000589419 B3GALT6Q96L58 329 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92 ms