RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 AGPAT1Q99943 283 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT15Q9BQS2 421 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT11Q9BT88 431 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SPG21Q9NZD8 308 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 INSL6Q9Y581 213 aa6.41□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 USP27XA6NNY8 438 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP99D6REC4 459 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GABRDO14764 452 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TACC1O75410 805 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 BEST1O76090 585 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 VNN2O95498 520 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 EFEMP2O95967 443 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP11A1P05108 521 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPING1P05155 500 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 P4HA1P13674 534 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFAIP3P21580 790 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GNA15P30679 374 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 BMPR1AP36894 532 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS7P49802 495 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF11P52732 1056 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GSDMDP57764 484 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FMO1Q01740 532 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 INCA1Q0VD86 236 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMD5Q16401 504 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NAA35Q5VZE5 725 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC30AQ86WT1 665 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL23Q86XA0 190 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CNGA4Q8IV77 575 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TDHQ8IZJ6 230 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR152Q8TDT2 470 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 POF1BQ8WVV4 589 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MYLPFQ96A32 169 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PANX2Q96RD6 677 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MED10Q9BTT4 135 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PRO3102Q9H379 93 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PLXNA3P51805 1871 aa6.4□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 HIDE1A8MVS5 230 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 M0QYV0 167 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 O00370 1275 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 AKR1B10O60218 316 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC24AO95486 1093 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL14O95715 111 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SOD2P04179 222 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CPB1P15086 417 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TYMPP19971 482 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCB4P21439 1286 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RFX1P22670 979 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BDNFP23560 247 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2F1P24903 491 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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