RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 KCNA3P22001 575 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CD6P30203 668 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CPT1AP50416 773 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PMS2P11Q13670 270 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 E2F2Q14209 437 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 KRT72Q14CN4 511 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.66□□□□□ -1.34
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TSG101-211ENST00000580814 CCDC89Q8N998 374 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TEX19Q8NA77 164 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 KIAA1191Q96A73 305 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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TSG101-211ENST00000580814 KCNQ3O43525 872 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 MYL4P12829 197 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PPM1AP35813 382 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 BLOC1S1P78537 153 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 FANCBQ8NB91 859 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 FAM136AQ96C01 138 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TRIM5Q9C035 493 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 VPS11Q9H270 941 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.65□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 AQP7P3A6NL99 342 aa6.64□□□□□ -1.35
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TSG101-211ENST00000580814 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 RAB27BO00194 218 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PRRG2O14669 202 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PLA2G6O60733 806 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TPH1P17752 444 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ABCB4P21439 1286 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 HSPA7P48741 367 aa6.64□□□□□ -1.35
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TSG101-211ENST00000580814 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 VPS53Q5VIR6 699 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SKAP1Q86WV1 359 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ZNF384Q8TF68 577 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 NCANO14594 1321 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ADAMTS3O15072 1205 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 RRM1P23921 792 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
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TSG101-211ENST00000580814 NXPH1P58417 271 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TAP1Q03518 808 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ITIH3Q06033 890 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PTPAQ15257 358 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 VWA1Q6PCB0 445 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 DTX2Q86UW9 622 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SSH3Q8TE77 659 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ASB10Q8WXI3 467 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ZNF566Q969W8 418 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ZNF747Q9BV97 191 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.63□□□□□ -1.35
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