RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577988.2

SNORD3B-1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3B-1, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3B-1, Length 758 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3B-1-201ENST00000577988 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TASP1Q9H6P5 420 aa14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KRT82Q9NSB4 513 aa14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 IL37Q9NZH6 218 aa14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 A0A1W2PRU2 124 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 LGALS16A8MUM7 142 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 DCXO43602 365 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 NPR3P17342 541 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 YWHAQP27348 245 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ADORA2BP29275 332 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KCNMA1Q12791 1236 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ORC1Q13415 861 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TEAD2Q15562 447 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CNGA2Q16280 664 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PTPN21Q16825 1174 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 GPR152Q8TDT2 470 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ING5Q8WYH8 240 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KAT5Q92993 513 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KCNK16Q96T55 309 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SMOQ99835 787 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KCNK12Q9HB15 430 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 HESX1Q9UBX0 185 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.71□□□□□ -0.05
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 NCANO14594 1321 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 FAM92AA1XBS5 289 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TNFRSF10BO14763 440 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ECI2O75521 394 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CD19P15391 556 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PDE6CP51160 858 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ZNF132P52740 706 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CACNA2D1P54289 1103 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MAP3K7CLP57077 242 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TDGQ13569 410 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MTMR3Q13615 1198 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 HTR4Q13639 388 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MEA1Q16626 185 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 GPR158Q5T848 1215 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MON1AQ86VX9 555 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SHC3Q92529 594 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SMARCD2Q92925 531 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ASB16Q96NS5 453 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SIX2Q9NPC8 291 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 OBP2AQ9NY56 170 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.7□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 O00370 1275 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MED7O43513 233 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KRT5P13647 590 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 GJA1P17302 382 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 BCAT1P54687 386 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 BPIFB4P59827 614 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CBX8Q9HC52 389 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 OBSL1O75147 1896 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 A0A0C4DFX4 3053 aa14.69□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 HHLA1C9JL84 531 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 BEST1O76090 585 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SETSIPP0DME0 302 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 UCHL3P15374 230 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SLC5A3P53794 718 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 UBXN1Q04323 297 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PTK2Q05397 1052 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TAF10Q12962 218 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNORD3B-1-201ENST00000577988 STKLD1Q8NE28 680 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms