RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 LEFTY2O00292 366 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 DCLK1O15075 740 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 CAVIN2O95810 425 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 ABL1P00519 1130 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 TNNI1P19237 187 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 STK38Q15208 465 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 C2orf27AQ580R0 203 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 RDH13Q8NBN7 331 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 FNBP1Q96RU3 617 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 TNMDQ9H2S6 317 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPRJQ12913 1337 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM163BP0C2L3 166 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 SEC13P55735 322 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 USP46P62068 366 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 HPS3Q969F9 1004 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 PCED1BQ96HM7 432 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 INVSQ9Y283 1065 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 TNNC1P63316 161 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 USP33Q8TEY7 942 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 C8orf48Q96LL4 319 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 CUEDC2Q9H467 287 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 OBSL1O75147 1896 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC12A4-208ENST00000572010 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 F8VP50 259 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 K7EQS6 105 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TACC1O75410 805 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 OPRD1P41143 372 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ASIC1P78348 528 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC7A9P82251 487 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 RNF38Q9H0F5 515 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 MTMR6Q9Y217 621 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ALDH1A2O94788 518 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 KCNK5O95279 499 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ZXDBP98169 803 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TAF10Q12962 218 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TRPC3Q13507 836 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ANO7Q6IWH7 933 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TTC30AQ86WT1 665 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 IQUBQ8NA54 791 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TCEAL3Q969E4 200 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 EDEM2Q9BV94 578 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 TRIM9Q9C026 710 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 CPQQ9Y646 472 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ACACBO00763 2458 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 SPTLC2O15270 562 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 PMLP29590 882 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 HOXD13P35453 343 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 DHX58Q96C10 678 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 PNKPQ96T60 521 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 C4orf47A7E2U8 309 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 A8MXQ7 604 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4-208ENST00000572010 CLIC2O15247 247 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms